miRNA-34基因家族进化分析及其在鹅生殖周期内的表达变化

doi:10.11843/j.issn.0366-6964.2016.02.007

畜牧兽医学报 ›› 2016, Vol. 47 ›› Issue (2): 260-267.doi: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.02.007

miRNA-34基因家族进化分析及其在鹅生殖周期内的表达变化

刘然^1，2#，张惠子^1#，云皓琪¹，陈阳^1，2，黄正洋^1，2，张扬^1，2，徐琪^1，2，陈国宏^1，2*

（1.扬州大学动物科学与技术学院，扬州 225009； 2.江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室，扬州 225009）

收稿日期:2015-06-10 出版日期:2016-02-23 发布日期:2016-02-23
通讯作者: 陈国宏，E-mail：ghchen@yzu.edu.cn
作者简介:刘然（1990-），女，山东济宁人，硕士生，主要从事动物遗传育种与繁殖方面研究，E-mail:betterlr@163.com；张惠子（1993-），女，江苏连云港人，本科生，主要从事动物科学研究，E-mail：15396752381@163.com。刘然和张惠子为并列第1作者
基金资助:
江苏省高等学校大学生创新创业训练计划项目（201411117050Y）；现代农业产业技术体系建设专项CARS-43-3）；江苏高校优势学科建设工程资助项目（苏政办发［2011］137号）

Molecular Evolution Analyzing of miRNA-34 Gene Family and Its Expression in Goose Reprodutive Cycle

LIU Ran^1，2# ，ZHANG Hui-zi^1# ，YUN Hao-qi¹，CHEN Yang^1，2，HUANG Zheng-yang^1，2，ZHANG Yang^1，2，XU Qi^1，2，CHEN Guo-hong^1，2*

（1.College of Animal Science and Technology，Yangzhou University，Yangzhou 225009，China；2.Jiangsu Key Laboratory of Animal Genetics & Breeding and Molecular Design，Yangzhou 225009，China）

Received:2015-06-10 Online:2016-02-23 Published:2016-02-23

摘要/Abstract

摘要：

旨在探明miRNA-34基因家族（miRNA-34s）系统进化历程及其在鹅生殖周期内的表达变化规律。通过文献和miRBase数据库检索脊椎动物的miRNA-34s序列，利用Ensembl数据库信息，确定miRNA-34s在基因组中的位置，采用MEGA 6.0构建miRNA-34s的系统进化树；并利用RT-qPCR检测鹅卵巢组织miRNA-34s在生殖周期内的表达变化。结果在脊椎动物中共搜索70余条miRNA-34s序列，miRNA-34s 3个成员（miRNA-34a、miRNA-34b和miRNA-34c）在脊椎动物中分布广泛，高度保守，均位于基因间隔区（Intergenic region，IGR )，且miRNA-34b和miRNA-34c两个基因位于同一染色体上，在进化过程中紧密相连，可能是由于串联重复所致。RT-qPCR检测结果显示，miRNA-34s 3个成员在鹅的开产前期、排卵期、排卵后期和就巢期卵巢组织中表现出相同趋势的表达，即在排卵期、排卵后期表达水平高于或显著高于开产前期和就巢期。miRNA-34家族在进化中高度保守，且在调控鹅生殖周期中发挥一定的作用。

Abstract:

This experiment was conducted to investigate the miRNA-34 gene family evolutionary process and its expression regularity in goose reproductive cycle.The miRNA-34 genes were searched in literatures and miRBase.It’s genes were located by Ensemble database，and its phylogenetic tree was constructed by MEGA 6.0.In addition，the expression level of miRNA-34s was detected in ovarian tissue of goose reproductive cycle using RT-qPCR.A total 70 sequences in 27 species which indicated the extensive existence of miRNA-34s(miRNA-34a，miRNA-34b and miRNA-34c) in different species.The analysis of gene localization showed all miRNA-34 genes were located on the intergenic region(IGR).miRNA-34b and miRNA-34c shared on the same chromosome and they were closely linked in evolutionary process，which maybe caused by tandem repeats.Besides，the similar expression of miRNA-34s were detected in goose ovary tissues of pre-laying stage，ovulation，oviposition，and the broody phase.More miRNA-34s expression was detected at ovulation，oviposition than that in pre-laying and broody phase period.The miRNA-34s are highly conservative in evolution process，and play a role in regulation reproductive activity in goose.

中图分类号:

S835.2

刘然，张惠子，云皓琪，陈阳，黄正洋，张扬，徐琪，陈国宏. miRNA-34基因家族进化分析及其在鹅生殖周期内的表达变化[J]. 畜牧兽医学报, 2016, 47(2): 260-267.

LIU Ran，ZHANG Hui-zi，YUN Hao-qi，CHEN Yang，HUANG Zheng-yang，ZHANG Yang，XU Qi，CHEN Guo-hong. Molecular Evolution Analyzing of miRNA-34 Gene Family and Its Expression in Goose Reprodutive Cycle[J]. ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA, 2016, 47(2): 260-267.

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https://www.xmsyxb.com/CN/Y2016/V47/I2/260

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